广州12号线共有20个车站，分布在番禺区和白云区。其中番禺区的站点包括南沙客运港、南沙码头、石碁站、新造站、大岭村站、夏良站、金洲站、飞鹅岭站、赤草站和番禺广场站；白云区的站点包括龙归站、人和站、机场南站、黄村站、永泰站、金坑站、镇龙站、镇龙西站和温泉站。12号线穿越了广州市南北两个主要区域，连接了南沙港口和白云国际机场，为广州市民提供了便利的地铁出行方式。