在入户清查时，单位名称以营业执照、登记证书或者其他合法文件上的正式注册名称为准。这些文件是单位合法经营的重要证明，也是单位名称的官方认可和确认。

因此，在进行入户清查时，应该以这些文件上的单位名称为准确依据。任何非正式或非法文件上的名称都不能作为单位名称的认定标准。只有通过官方渠道正式注册的名称才能被认可和采纳。

因此，在执行入户清查时，必须严格按照单位正式注册的名称进行清查和认定。