PCR扩增的引物一般从DNA的末端开始复制，一对引物的5'端氧基与3'端磷酸基匹配，可以使引物稳定地结合到DNA模板上，并在热循环过程中起到复制作用。

引物的设计应避免出现二硝基和三硝基等问题，对于G-C含量较高的序列引物设计应使GC含量尽量均衡。PCR扩增的引物选择对扩增效率和特异性都有重要的影响，正确选择合适的引物可以保证扩增结果的准确性和可重复性。