农业银行卡长期不用不会自动注销。但是为了避免卡内余额被盗刷，建议长期不用的银行卡在使用前定期查询一下账户余额及交易明细，如果发现有异常交易及时联系银行处理。

同时，也可以考虑办理全球通卡，该卡在长达5年未使用后，将被自动注销，以保障用户的账户资金安全。