高二学生不能申请马来西亚本科。

申请马来西亚本科需要完成高中阶段的学业，并获得高中毕业证书，但高二学生并没有完成整个高中阶段的学业，因此无法申请马来西亚本科。

高二学生可以参加一些暑期交流或者留学项目，以获得更多的国际交流经验和提高自己的学习能力。

同时，也需要认真学习高中课程，为将来的留学打好基础。