医院开药有自费部分主要是因为医疗保险政策的限制和药品价格的不同。在医疗保险政策的限制下，医院只能开一些特定的药品，并且医保只能支付一定的费用。

因此，如果患者需要使用一些特殊的药品或者具有高价值的药品，那么医院就需要收取自费部分来弥补药品的差价，以保证患者获得充分的治疗和药物支持。

另外，药品价格也是导致医院开药有自费部分的原因之一。一些特定的药品价格较高，医保无法支付全额费用，而医院又不想将这些药品全都分摊给患者，于是只好要求患者支付药品的自费部分，以确保医院的经营利润和医疗服务的稳定性。