穴小鸮喜欢吃节肢动物，如甲虫和蝗虫等。

当然，小型哺乳动物如啮齿类也是穴小鸮的主菜之一。和其他的猫头鹰不同，穴小鸮有时也吃果实和种子，特别是仙人球或仙人掌果。