工作原理。离心式冷水机组通过电机带动叶轮旋转，产生离心力，将冷媒压缩并输送到冷凝器中，实现制冷过程。磁悬浮冷水机组采用磁悬浮压缩机，利用磁浮轴承技术将转子悬浮在磁场中旋转，实现压缩冷媒的过程。磁悬浮压缩机具有旋转惯量小、运动平稳等特点，能够减小振动和噪音，提高运行效率1。
能耗。磁悬浮冷水机组在启动时能够以较低的额定电流启动，有效降低了起动电流对电网的影响。在运行状态下，由于其磁悬浮压缩机具有高效节能、无摩擦损耗等特点，能够有效降低机组能耗。而离心式冷水机组需要通过调节运行电流、改变风量来实现节能，而且机组启动电流较大，对电网的影响较大1。
稳定性。磁悬浮冷水机组由于采用磁浮压缩机，能够避免机械轴承摩擦产生的热量和磨损，从而提高机组的稳定性和可靠性。而离心式冷水机组通常需要隔年维修保养，以保证机组的长时间运行稳定1。
系统复杂度。磁悬浮冷水机组由于使用的是磁悬浮轴承，系统不再需要润滑油对轴承进行润滑，这就减少了供油和回油管路，结构看起来往往比较简单。而离心式冷水机组结构看起来往往比较复杂，需要对润滑油进行提纯和回收2。
噪音和震动。磁悬浮冷水机组由于采用的是磁悬浮轴承，相比滑动轴承这类机械轴承，其振动和噪音都会降低很多。而离心式冷水机组转速高，一般9000-40000转/分钟，且利用叶片、叶轮吸、排气，所以其噪音值较螺杆机要高一点并且尖锐些3。
维护工作量。磁悬浮冷水机组由于无油，因此也就不需要定期换润滑油和油过滤器等，相比之下这也会节约一大笔维保费用。而离心式冷水机组需要定期换润滑油和油过滤器等，相比之下这也会增加维保费用2。
环保性能。磁悬浮冷水机组可选用环保冷媒，对臭氧层0伤害，而且运行时噪音很小。而离心式冷水机组可采用各种制冷剂，