在装修时，将屋内的门禁系统拆除的原因可能是为了方便施工和安装。装修过程中可能需要更换门框、门扇，或者对墙体进行改造，如果不拆除门禁系统，可能会影响施工进度和效果。

此外，拆除门禁系统也可能是为了更换新的门禁设备或者进行维修、更新升级等操作。在拆除前，需要通知相关人员，并采取措施确保安全。装修结束后，需要及时恢复门禁系统的使用。