如果分开购买中转的学生票，那么算两次。

1. 因为票务系统中，每一张车票都有一个唯一的订单号，如果中转的学生票分开购买，那么车票就会对应两个不同的订单号。

2. 而且，分开购买的车票，还需要在中转的地点重新验证身份、托运、检票等，增加了不必要的步骤和时间。

因此，建议购买中转的学生票时应当一次性购买，避免不必要的麻烦和费用。