杭州市民卡丢失后，不能直接在支付宝上申请补办，需要前往银行窗口进行补办。

具体步骤如下：

打开支付宝APP，点击上方的市民中心。

在市民中心页面中，找到右边的社保并进入。

进入社保页面后，找到社保卡服务并进入。

在社保卡服务页面中，点击下方的社保卡补卡缴费。

在补卡缴费页面中，选择个人选项并输入个人信息即可申请补卡。

需要注意的是，补办市民卡需要准备个人身份证、身份证复印件以及本人银行卡等相关材料，具体情况以银行规定为准。