青海省博物馆分为七个部分，分别是藏传佛教文物、青海历史文化、民族艺术珍品、国际礼品、青海自然资源、古唐史料以及特展展厅。

藏传佛教文物部分展出了大量珍贵的佛教文物和文化遗产，如唐卡、佛像和高僧法器等；青海历史文化部分集中展示了青海历史、文化和文物的发展演变历程；民族艺术珍品部分专门展示了青海各民族传统艺术和手工艺品等；国际礼品部分则展示了世界各国赠送给中国政府的珍贵礼品；青海自然资源部分展示了青海自然风光、生物多样性和地质特色等；古唐史料部分则展示了唐朝对青海的开发和统治历史等；而特展展厅则不定期推出各种丰富多彩的主题展览。