1. 功能差异：金山PDF专业版相对于独立版具有更丰富的功能。专业版通常包括高级编辑工具、转换为其他文件格式、添加和管理数字签名、批注和标注工具等高级功能，而独立版可能仅提供基本的查看和打印功能。
2. 价格差异：由于功能的不同，金山PDF专业版的价格通常会比独立版更高。
3. 适用对象：金山PDF专业版主要面向需要更多功能和高级操作的用户，例如专业人士、企业或机构，他们需要进行复杂的PDF编辑和处理。而独立版则适用于一般用户，他们只需简单地查看和打印PDF文件。
4. 软件集成：金山PDF专业版可能会与其他金山办公套件的软件（如WPS Office）集成，可以方便地在不同应用之间进行文件转换和编辑。而独立版则是一个独立的应用程序，不会与其他软件集成。
虽然金山PDF专业版和独立版在功能和定位上有所差异，但根据你的需求选择合适的版本即可。如果你需要进行更复杂的PDF编辑、转换和签名等操作，建议选择金山PDF专业版。如果只是简单地查看和打印PDF文件，独立版就足够满足需求了。