在《火影忍者》这部动漫中，第四代火影波风水门在对战佩恩时并没有复活；实际上，水门的复活是在动漫后期发生的，与佩恩的战斗无关。水门是通过第二代火影千手扉间发明的“伊邪那岐”禁术以及后来鸣人和斑使用六道之力进行的仪式复活的。

在动漫的宇智波斑揭露真相的章节中，揭示了水门其实是通过“伊邪那岐”被转移到另一个空间，而不是死亡。之后，在第四次忍界大战期间，鸣人和斑利用六道仙人的力量，将之前牺牲的忍者们召唤回来，水门也是其中之一。这样，水门得以以活着的状态重新出现在战场上，并帮助忍者联军对抗敌对势力。