全国通办护照个人旅游除外指的是持有全国通办护照的旅客，在个人旅游方面不能享受某些优惠政策或者服务。

例如，一些景点可能只对当地居民或者本省居民实行免费或者优惠门票政策，持有全国通办护照的旅客就不能享受相应的优惠；再比方说，当地的一些旅游企业也可能优先选择本地游客或者此前达成某些协议的旅游团队，而对全国通办护照个人旅游的游客则不予接待。因此，持有全国通办护照的旅客在个人旅游时需要特别留意相关的政策和服务内容，以避免不必要的麻烦和损失。