如果营业执照上的法定代表人发生变更，且车辆是公司名下的，则需要进行车辆的所有权变更登记。具体操作流程如下：

1.在车辆管理所或者交警部门办理变更登记手续，需要提供原营业执照、新营业执照、变更登记申请书、法定代表人身份证等材料；

2.按照要求缴纳相应的费用；

3.当车辆所有权登记完成后，领取到变更后的行驶证和车辆登记证书。

需要注意的是，如果公司的名称、住所等信息也发生变更，则还需要办理相应的工商变更登记手续。