1688平台在交易超时的情况下，确实会自动进行赔付。这种赔付机制主要是为了保护买家的权益，确保交易的顺利进行。

具体来说，当买家在1688平台上购买商品并付款后，如果卖家未能在规定的时间内发货或完成交易，系统将会自动判断为超时。在这种情况下，平台会自动对买家进行赔付，通常是以返还买家支付金额的形式进行。

需要注意的是，赔付的具体金额和规则可能会因不同的商品类型、交易模式以及平台政策而有所差异。因此，在实际操作中，买家最好先了解清楚相关规则和条款，以便在需要时能够得到及时有效的保障。

总之，1688平台在交易超时的情况下会自动进行赔付，这一机制有助于保护买家的权益，促进交易的顺利进行。