熊猫的性别由性染色体决定，雌性大熊猫的染色体为XX，雄性大熊猫的染色体为XY。

大熊猫没有明显的第二性征，它的肛门外缘的皮肤伸缩性较大，包住了雄性的生殖器、睾丸以及雌性的外生殖孔。