如果南方的车主要将车辆运回东北地区，首先需要向当地的物流公司或车运公司咨询相关的运输方案和费用，选择可靠的运输服务商。

在运输过程中，车主需要对车辆进行检查和保护措施，如拆下车载物品、去油去泥、贴好保护膜等。

同时，在交付车辆前需要认真签订相关的合同并备好相关资料，如车辆登记证、行驶证等。

最后，需要与物流公司协商好运输的时间和地点，确保整个过程顺利进行。