网络教育毕业档案是一份重要的资料，必须妥善保管。毕业档案要存放在比较安全、有干燥、阴凉、避光的地方，以免被水污染、潮湿变质。可以采取符合胶片、折叠、固定等方式将其进行保管，以免损坏。在使用得宜的情况下，尽量减少拆封和翻阅，以保持毕业档案的完整性，并且及时补充收入相关的新资料。