南通地铁一号线南大街站共有2个入口。

因为根据南通地铁一号线的站点设置和设计规划，南大街站只设有2个入口，分别位于南大街以东和以西。

所以总入口数为2。

另外，地铁入口的设计有多种考虑，如周边环境、市政规划和客流分布等，一个地铁站的入口数也不同，既有多口入口的，也有少口入口的。

对于南大街站来说，设计两口入口也是合理的选择，可以满足当地交通需求。