公安机关查扣假币鉴定后一般会将其移交给中国人民银行进行处理。

原因是负责全国货币发行、管理和运作的中国人民银行具有最高的货币标准和最权威的货币鉴定能力，对于假币的处理方式和程序也有明确规定和流程。

同时，中国人民银行还会对这些假币进行进一步鉴别和统计工作，以保证真币和假币的区分，进一步活跃货币市场。

相应的处罚措施也会加强，如对于散布假币的犯罪嫌疑人会受到刑事追诉。

由于技术的进步和假币制造成本的降低，假币犯罪已成为一种全球性的经济犯罪现象。

处理假币的流程和方法也需要持续加强和优化，从而减少假币的制造和流通。