是的，如果发生了超市火灾事故，超市虽然采取了关门措施，但仍然可能会被消防部门处以罚款。因为消防部门的主要目的是确保公共场所的火灾安全，超市在实际经营过程中应负有安全管理责任，如未能完全做到防火安全，还是需要承担相应的罚款责任。因此，超市在采取关门措施的同时，还需积极落实各项安全措施，确保超市在遇到火灾等突发情况时，能够及时有效地应对。