南京南站归上海管。

南京南站虽然位于南京市，但是其建设和管理主要是由上海铁路局负责。

这是因为南京南站是沪宁城际铁路的一个重要站点，而沪宁城际铁路是由上海铁路局负责建设和管理的，因此南京南站也归上海铁路局管辖。

南京南站是一个重要的交通枢纽，承担着连接南京和上海的重要任务。

作为重要的铁路交通枢纽，南京南站的建设和管理必须要有一定的统一性和协调性，这也是为何南京南站归上海管的原因之一。

南京南站在建设和管理上的一致性可以帮助确保其正常运行和更好的服务于广大旅客。