自交和自由配对是生物遗传学中的两种基本实验方法，它们的主要区别在于实验对象和实验设计。自交是让同一物种的个体之间进行交配，而自由配对则是将实验个体随机分组，然后让它们相互匹配。这两种方法在解题中的应用取决于具体的问题和要求。

解题方法：

1. 确定实验目的：首先，要明确实验的目的和目标，确定需要解决的具体问题。

2. 选择合适的方法：根据实验目的，决定是使用自交还是自由配对。通常，如果需要研究个体的遗传特性，特别是对于纯合子或隐性个体，自交是一个合适的方法。而自由配对则更适用于研究群体间的相互作用或遗传差异，特别是在需要比较不同个体或组之间的匹配情况时。

3. 分析数据：使用选择的方法后，根据实验结果进行分析。自交时，关注个体的遗传组成和后代的表现；而自由配对则关注配对个体的匹配程度和它们的后代表现。

自交和自由配对的区别：

自交：自交是一种特定的交配方式，涉及两个相同的个体相互交配。其优点是可以产生纯合子，有助于理解基因的显隐性关系。然而，自交可能会受到环境因素的影响，导致结果的可重复性较差。

自由配对：自由配对是一种实验设计方法，涉及将个体随机分组并让它们相互匹配。这种方法有助于消除个体间的选择性压力，从而更好地反映遗传特性。它特别适用于比较不同个体或组之间的匹配情况，或研究基因与环境之间的相互作用。

详细说明原因：

自交的优势在于可以产生纯合子，这对于理解基因的显隐性关系非常重要。然而，由于环境因素的影响，自交结果可能受到干扰，导致结果的可重复性较差。因此，在某些情况下，自由配对可能更合适，因为它可以消除环境因素的影响，更好地反映遗传特性。

自由配对的好处是它可以消除个体间的选择性压力，从而更好地反映遗传特性。此外，通过自由配对，可以比较不同个体或组之间的匹配情况，或研究基因与环境之间的相互作用。