1688退货包运费的扣费规则根据不同的情况而有所不同。如果是买家自行取消订单或主动申请退货，则运费是买家自行承担，卖家无需扣费。

如果是卖家出现质量问题或发错货，导致退货，卖家需要承担运费，不可从买家退款中扣除运费。

如果是因物流原因导致的退货，则卖家需要在退款款项中扣除买家的运费。

卖家在处理退货时需要根据具体情况，合理扣除运费，并及时与买家沟通，共同解决问题。