业主大会公章应该由物业公司保管。

因为物业公司作为业主大会的专业服务机构，负责协助业主委员会组织开展业主大会并对相关决定进行实施。

保管公章能够确保公章不被滥用，维护业主大会的权威性和合法性。

另外，物业公司在处理相关事务时需要使用业主大会公章，所以也更方便管理和使用。

值得一提的是，业主大会公章的使用必须符合相关规定，在需要使用前必须获得业主委员会授权，并在使用后及时返还业主委员会，以免造成损失和不必要的纠纷。